时为1987年，乔瑟夫·乔斯达与“柱之男”们之间的死战后过了50年……乔瑟夫为了为了帮助“被恶灵附身了”的外孙子·空条承太郎而来到了日本。原来那并不是恶灵而是幽波纹（替身）。替身突然出现的原因在于，从跨越100年的长眠中苏醒过来的吸血鬼·DIO与乔斯达家之间的令人忌讳的因缘。为了拯救受到DIO的诅咒而倒下的承太郎的母亲·荷莉，他们决定要打倒邪恶的化身·DIO，和伙伴们一起踏上了旅程。

在乔斯达家的宿敌·迪奥（DIO）复活的影响下，一位年轻人——空条承太郎，得到了名为“幽波纹（替身）”的能力。为了拯救因迪奥的诅咒而倒下的母亲荷莉，空条承太郎与外祖父·乔瑟夫以及伙伴们，一起为了打倒迪奥而展开旅程。在漫长的旅途当中，承太郎等人一次又一次地击退刺客，最后终于抵达迪奥所在的埃及。然而，为了阻止他们前进，各种怪异可怕的新一波敌影不断逼近——